Договариваюсь о сдаче в аренду своей квартиры на Кипре. Есть вариант, что съемщиком квартиры будет выступать юр лицо. Какие подводные камни? Особенно, если арендная плата будет поступать от юр лица на мой счет в банке кипра?

Никаких. Мне так снимает квартиру моя компания. Наоборот, как мне кажется, арендатор более защищён. Дай Бог, свой дом закончу ремонтировать, была бы счастлива его отдать в аренду компании