Столкнулся с ситуацией что работодатель применял полгода налоговый вычет 50%, хотя я до трудоустройства был visitor и координировался с ними по выезду/въезду на остров, говорил что я не имею права на скидку. Не заметил сначала в первые пару месяцев, так как база налоговая была низкая, но когда заметил в новом году - сразу сообщил. Вопрос - кто в итоге должен платить разницу в налоге за прошлый 2025 год? Могут ли сейчас быть штрафы для меня по налоговой задолженности?

Зависит от того, как зарплата оговорена в трудовом договоре - гросс или нет

Гросс

Значит вы получили на руки разницу за счёт льготы, которую надо доплатить

А если я уведомил при трудоустройстве работодателя об отсутствии льготы и если возникли штрафы (этого я не знаю наверняка) в связи с неуплатой этой разницы - на ком ответственность?

Ответственность, которая возникает при подаче годовой декларации, - на вас