Я правильно понимаю, что если в 2026 году первые 3 месяца получаю зп на ип в Грузии, и потом с апреля на Кипре, тоесть становлюсь резидентом - налог за январь-март с доходов в Грузии я не должна доплачивать на Кипре в налогах ща 2026 год?

Вы не можете получать зп на ИП (формально это не зарплата). На Кипре вам нужно будет декларировать и платить налоги с доходов за весь календарный год.

Только если зарплата по трудовому контракту была, а не по сервисному.