может ктото уже сталкивался в свете подачи документов на гражданство, что если штампы о пересечении границы плохо видны, или вообще стоит половина штампа, а вторая мимо паспорта ? насколько это проблема?

Личные кабинеты авиалиний, там как правило сохраняется история полётов с датами. Штампы вылета и вылета на Кипр ставят как правило всегда, а вот прилет в EU иногда могут скинуть

а в миграции принимают скриншоты личных кабинетов? может есть возможность запросить справку в госоргане о датах пересечения границы?

А зачем вам это? Вы сомневаетесь, что ваших дней не хватает? Или думаете, что миграционная служба ориентируется только по скринам вашего паспорта? Я думаю, что нет, ваши данные проверяются. Достаточно сделать файл с вашими реальными влетами/вылетами и посчитать дни.

То есть если дней точно хватает, можно не сильно и переживать по этим штампам?

Если выезды были менее чем на 90 дней за раз, то алгоритм подсчета несложный, муж в Экселе написал скрипт. Можно заложить ещё дни если были посещения оккупированной территории. Мы подавались уже после LTRP, поэтому у нас было дней на 6+ лет