Кто подскажет, после подачи на натурализацию включаются ли какие-то дополнительные ограничения по дням отсутствия на Кипре по сравнению с теми, которые есть у меня сейчас в связи с текущим миграционным статусом?

нет. формально можно даже вообще уехать с острова и потерять внж. но когда дело дойдет до рассмотрения кейса это могут учесть. ну и когда на собес пригласят, то лучше быть где-то недалеко, а не "ой. я тут в Антарктиду на зимовку поехал"