Подскажите, если не писать заявление о закрытии счета, а просто покинуть остров, чем это может грозить? ВНЖ закончилось.В банке остался только "гаранти депозит".

Обнулят что есть и будет висеть депозит пока не закончится, потом и его обнулят.

А дальше, счёт то не закроют автомаьически, или как? Будут ли потом проблемы ? Если например захочется приехать

Пока есть депозит - совсем счёт закрыть не могут. Пока в минус не загоняли, но может придумают и это ещё.