Подскажите, а как технически происходит регистрация договора в налоговой? Просто взымают сбор и шлепают печать или снимают копию, заносят в реестр и все такое?

Считают марки, клеишь, сверху шлепают печать.

Два раза очередь стоять? Марки как я понял, там на месте не продаются же?

В Лимассоле налоговая прям в здании почты и очередей там обычно нет. Но можно вообще прийти с пачкой марок заранее)