Кто знает, работа в российском филиале иностранной IT компании попадает ли под санкции?

Если компания не под санкциями, то нет. Но точно будут проблемы с выводом денег и есть санкции на оказание ИТ и других услуг, то есть с европейской материнской компанией будут сложности во взаимодействии.

Компания не европейская. Она не под санкциями. Ит услуги не оказывались. Человек числился в штате и получал зарплату в РФ. Разве, он не сможет эти деньги зачислить на кипрский счёт для подачи на пинкслип визитора?