Ещё вопрос, может у кого было также, если часть дохода в оффере идёт как settlement allowance, а не в salary, она как-то по другому учитывается в этих налогах?

Да, есть нюанс - некоторые выплаты не считаются доходом и не облагаются налогами, но и соответственно не засчитываются как доход для порога применения вычета. Relocation allowance до 9.000 вроде как не попадает, но точнее вам скажет грамотный бухгалтер. Причём именно грамотный, я уже не раз сталкивался что на Кипре бухгалтера просто забивают на benefits-in-kind и особенности их налогообложения.