Добрый день! Подскажите, пожалуйста, если в сертификат на антитела вписать двоих владельцев, но с котом полетит только один из них, могут ли на границе возникнуть вопросы какие-то?

Скорее всего нет, так как в титрах пишут номер чипа животного, на это смотрят .