В приложении Aegean пишут что нужно заполнить в аэропорту Контрольный лист приёма живых животных, это на стройке регистрации?😅 Буду лететь первый раз с маленькой собакой в салоне , еще и с транзитом в Афинах

Да, вроде, какие-то такие бумаги на регистрации заполняли.

Это в багаж скорее всего. Летала в декабре в Афины и на этих выходных в Салоники, да и до этого частенько по разным направлениям - нет никакого контрольного листа приема для животных в салоне самолета.