Что выгоднее с т.з. теплопотерь и расхода топлива для котла - поставить температуру пониже (тогда насос будет работать больше, а котёл включаться-выключаться чаще) или наоборот повыше (тогда насос будет выключаться вместе с котлом от термостата)?

Низкотемпературная система выгоднее.

не будет ли у неё больше потерь на трубах до котла (которые неизвестно как изолированы, а котёл вне дома)?

Наоборот если температуры трубы и воздуха равны, можно и без теплоизоляции ))). А если серьезно - если хватает 30⁰ на отопление (теплые полы) это самый экономичный режим.

Не, у меня батареи. В том году прожил на сорока, из минусов - воду в баке не подогреть толком