12.5% — ниже нет нигде, поэтому и вопрос стал касательно Кипра

Вам нужен специалист по итальянскому налогообложению. У него выяснить как облагаются доходы от филиалов иностранных компаний. Вполне может быть, что они все равно будут облагаться итальянскими налогами на прибыль и налоговая резиденция на Кипре вам ничего не даст.