Доброе утро. Подскажите, реально ли на Кипре открыть ИП для ITшника, чтобы работать по B2B и жить при это на северной части острова? Или может есть какие инкубаторы, через которые можно так работать?

ИП только для граждан ЕС

Нет. Ни первое, не второе невозможно. ИП тут нет, есть селфимплоймент, только для граждан ЕС и Кипра и их супругов. Проживать постоянно на оккупированной части незаконно.