Здравствуйте можно ли заехать на Кипр по Болгарской визе на 90 дней, выехать, и заехать по национальной визе Кипра ?

Нет, они суммируются. Летом была два месяца по нац, осенью сделала болгарскую, влетала в октябре мне на паспортом контроле сказали у вас месяц, не 90 дней))