У самого когда-то ещё 15 лет назад был аналогичный случай с шенгеном. И тоже пришлось объясняться с пограничником (не авиакомпанией, они тогда так пристально не проверяли). Когда первые 90 дней были потрачены в самом начале первых 180 дней и решил через полгода снова заехать

С шенгеном хотя бы есть калькуляторы и разъяснения. Для кипрской визы такого нет, вот каждый и считает по своему разумению.

Правила одинаковые

Это сложно объяснить в Тае представителю Иорданской а/к.

Это да.