Добрый вечер! Вопрос по стыковкам! Ларнака-Ереван- Москва, правильно я понимаю, мы прилетаем в Ереван (получаем багаж) и заново проходим погранцов?

правильно.

Если одним билетом, то не получаете ( стыковочный рейс). Но есть и перелеты с получением багажа