Подскажите у агрегатора, например mego если взять билеты одним заказом где первый отрезок fly one а второй виззейр с пересадкой 1.5 часа то при отмене/задержке fly one этот агрегатор вернет деньги за виззейр?

Нет

Уже нашел на самом сайте mego что вроде как возврат делают за опоздание по причине задержки первого рейса

Самостоятельная стыковка=все риски пассажира