Подскажите, пожалуйста, покупая билет и указывая данные проездного документа, как быть с российским загранпаспортом, выданным в посольстве кипра, какую страны выдачи указать?

Какая написана в загранпаспорте. А там написано: Россия. Страна выдачи это не страна в которой вам физически дали паспорт, это страна которая его изготовила для вас на основании того что вы ее гражданин