Скажите кто нибудь , если брать билеты одной авиакомпанией , египтейр с пересадкой . Они же сами багаж будут перезагружать , мне наверно не нужно его будет забирать ? И если пересадка 2 часа , нормально?Получается транзит? И если будут опоздания , они сами будут решать как быть дальше , ?

Все верно, они сделают все сами, вам об этом скажут на регистрации, когда будите сдавать багаж. По транзитному коридору пройдете и время еще останется.