Зависит от системы. Она у них автоматическая. То есть прикладываешь паспорт в специальную машину при переводе в транзит. Если систему все устраивает, Вам выдаются спец разрешение на проход дальше. Но бывают случает, что паспорт не считывается или random check, тогда отводят в отдельную комнату и разговаривают. У меня так и было: мужа и 2 летнюю дочь забрали в отдельное помещение - там очередь, в результате проторчали там 2 часа. Такое может быть, так что смотрите сами

Какими авиакомпаниями летели?

El Al