Здравствуйте! Подскажите пожалуйста, как лучше добраться из Ларнаки в Протарас

Лучше всего взять карш и поехать на нем, если общественный транспорт - автобусы интерсити ездят в айя-напу и паралимни, оттуда недалеко до протараса:
https://intercity-buses.com/en/routes/larnaca-ayia-napa-paralimni-paralimni-ayia-napa-larnaca/