Подскажите пожалуйста, если подросток без родителей летит в Москву ( есть только российский загранпаспорт) - как и куда потом загружать результаты его теста ? Через аккаунт госусдлуг родителя ? Или как?

Через его аккаунт надо уведомить и загрузить, упрощённая версия.

То есть надо на подростка, которому нет ещё 14 и соответственно нет внутреннего паспорта делать упрощённый аккаунт на госуслугах ?

Да, со смартфона легко делается.