Можно совет? У моего сына фамилия на английском в паспорте через c там указана , а сертификат в гос услугах автоматически переводит через S, это плохо ? Или сертификат о прививки в Флатскипасе указывает номер сертификата и буква не имеет значение ?

В сертификате еще номер паспорта есть. Буква не играет такую большую роль.

Не имеет. Разная транслитерация

Это неважно. "Флатскипасс" — это просто огонь.

Редактор, видимо, горнолыжный)