насколько я понимаю, телефон могу только с этой симкой пользоваться. или симку только с этим телефоном? вот только что смс пришло. если я телефон поменяю и вставлю симку. она будет работать?

Этот IMEI-слот только с этой симкой. Если поменять слот или телефон, то эта же симка будет работать.

переставив симку на другой телефон он будет работать да? потом 90 дней даст?

Верно

Это значит, что пошел отсчет 90 дней работы этого имея с местными сим( не важно, именно этот номер или другой). Пройдет 90 дней, переставите во второй слот, с вторым имеем, получите еще 90 дней. После этого, либо растоможка, либо ждать конца года, после чего опять те же сроки.