Подскажите, пожалуйста, какой документ нужно указывать на сайте EUDCC, чтобы получить QR-код на основании вакцинации Спутником? (Пробовал и загранпаспорт, и паспорт РФ - сайт выдаёт сообщение, что сертификат не найден). Заранее признателен!

Никакой. Читайте закреп на канале @cycovid19
Вам про это бот на входе написал 5 минут назад.