Добрый день! Подскажите пожалуйста по flight pass - если летят родители с Уфы с пересадкой в Москве - это direct flight to Cyprus?

добрый!
судя по сайту Cyprus Flight Pass не direct'ом считается рейс через третьи страны, а в вашем случае всё стандартно

"REGISTER TO FLY
Apply for your CyprusFlightPass within 48 hours before the commencement of your travel from the Country of Origin to the Republic of Cyprus (either direct flight or via intermediate Countries)."