правильно я понимаю, что резидентам Кипра, вакцинированным на Кипре, при перелёте из России на Кипр не нужно заполнять CyprusFlightPass и достаточно кипрского QR кода?

Нет, flightpass все равно необходимо заполнить.

Флайтпасс заполняют вообще все.